《幻卡骑士团》游戏最核心的系统功能之一——“卡组”。卡组主要包含切换卡组、全部卡牌、编辑卡组、合成分解和设为默认5个功能。每位玩家总共可以编辑4个卡组，以用于不同的战斗，比如自由对战、排位战、故事模式等。
在任意卡组下，点击卡牌可以查看卡牌的详情。
1. 【切换卡组】顾名思义，就是指在4个卡组之间进行切换。切换之后，玩家就可以在当前卡组进行操作了。
2.【设为默认】就是把当前卡组设为默认出战卡组，设为默认之后，进入战斗时，就会用玩家的当前默认卡组进行战斗了。
3.【全部卡牌】
玩家在全部卡牌列表里主要可以进行两项操作，出售卡牌换取金币或者是对某张卡牌进行升级，【卡牌升级】系统将会在后面提到。
4.【编辑卡组】
玩家可以使用编辑卡组功能编辑当前选定的卡组，在这个界面，点击左边列表的卡牌会把左边的卡牌加到卡组中；点击右边卡组中的卡牌则会把该卡牌从卡组中去掉。
玩家可以使用排序和筛选功能快速在左边找到自己需要的卡牌。
有个小技巧就是在这个界面，“长按”某张卡牌就可以查看卡牌的详情。
5.【合成分解】
通过分解合成，玩家可以使用稀有度A级以上的卡牌分解成碎片，并通过碎片合成新的卡牌。合成分解的具体方法将在其他资料中详细描述。