一、主角篇
漩涡鸣人
四代火影波风水门和第二代九尾人柱力漩涡玖辛奈之子，阿修罗转世。出生时父母为了保护木叶村，将强大的九尾封印在鸣人体内后牺牲。成为孤儿的鸣人在冷眼和孤寂中长大，但在唯一认同他的老师海野伊鲁卡的鼓励下，自己不断刻苦修炼的作用下，鸣人逐渐成长为一个伟大的忍者。
技能：色诱术、螺旋丸、风遁手里剑、通灵术、变身九尾等。
宇智波佐助
六道仙人长子因陀罗的转世，被鸣人视为重要的朋友。年幼时目睹宇智波一族被哥哥宇智波鼬所灭，从此走上了复仇之路。为了得到力量离开火影村追随大蛇丸，吸收大蛇丸力量的他杀死了哥哥，进而了解了灭族真相，决定摧毁木叶。最后在第四次忍界大战中，改邪归正，为了保护木叶而与鸣人并肩作战。
技能：豪火球、雷切、写轮眼、天照、须佐能乎等。
春野樱
第五代火影千手纲手的弟子，与漩涡鸣人、宇智波佐助隶属于旗木卡卡西领导的第七班，是新一代杰出的医疗忍者。具有良好的查克拉控制能力和清晰的头脑，擅长怪力和医疗忍术。经过自己艰苦卓越的努力奋斗，春野樱从一个平凡女孩，最终成长为一个贯彻自己座右铭“勇气”的优秀忍者。
技能：裂地击、春诛打、樱花冲、百豪之印、樱花吹雪等。
二、 装备强化和技能升级篇
1、 装备强化：在3级左右开启，通过消耗金币来提高装备强化等级，带来属性增长。装备强化上限等级不能超过角色等级。
2、 技能升级：主角的技能是按角色等级逐渐开启的，其中包括主动技能和被动技能，主动技能升级后伤害效果大幅提高，被动技能升级后可以增加战斗属性，升级技能需消耗金币、战功，等级越高消耗量则越大。
三、 副本\精英副本篇
1、 副本：游戏中副本贯穿了游戏整个主线剧情，是玩家获得金币、战功、装备合成材料的重要途径。副本战斗方式分为3种：限时杀敌、限数杀敌、斩将过关。通关副本后会根据玩家通关时间、最高连击、是否复活给出评分，最高为S，当前大关卡所有副本都为S评分时，可以领取全S奖励。通过左右滑动，可以查看前后大关卡的其他副本。有boss的精英副本，打通普通难度后，获得挑战精英副本的机会。普通副本每天通关数量无上限，精英副本每天可以免费通关1次。
2、 精英副本：在通关普通水木关卡后开启。所有有BOSS的副本都有精英难度，精英副本的难度远大于普通副本，但掉落也极其诱人，除了装备合成图纸以外，还有几率掉落对其他高级材料，所有已经通关的精英副本，每天可以免费通关一次，挑战失败不扣除次数直到通关为止。如果想挑战更多，可以消耗一点钻石来购买次数，VIP等级越高，每天可以购买的次数越多。
四、合成\宝石篇
1、 合成：在精英副本获得装备合成图纸后，就可以将现有装备合成为更高阶装备了。打开合成界面。缺少的材料边上会出现【自动寻路】按钮，点击后自动跳转到会掉落该材料的副本。材料都满足要求后，点击【合成】可以将原有装备变成属性更高的新装备，原有镶嵌宝石保留，原有强化等级降低5级。新装备拥有更高的成长属性。
2、 宝石：宝石在27级左右开启。每件装备默认有一个宝石插孔，镶嵌宝石获得对应的属性。解锁宝石孔需要一定钻石，每件装备最多可以镶嵌3个不同种类的宝石。宝石可以随时取出，不消耗任何资源，取出的宝石可以继续镶嵌到其他装备或者用于合成。两个相同宝石可以100%合成为下一级宝石，合成永远不会失败。宝石可以从家族商城处消耗钻石购买，或者从护送达兹纳玩法中获得。
五、日常任务
日常任务在15级左右开启。每人每天可以完成10次日常任务，获得大量经验和金币。日常任务会让玩家使用游戏里常用的功能，如果玩家对日常任务星级不够满意，可以消耗钻石来刷新。星级越高，经验和金币奖励越大。