雷霆舰队的商店分为两种一种是黑市，一种是商店。两个地方都出售不同的物品供玩家选择。
黑市里卖的东西比较少，大部分是通过游戏内的金币来获取相对应的零件、历练证明、名将邀请函残页等稀有物品。
但黑市的物品是不固定的，每六个小时都会进行免费刷新，每次刷新的物品也不一样。玩家也可以通过花费钻石来进行立即刷新，进行购买需要的物品。黑市每次刷新都是只有六个物品。
商店里的东西比较全面，有零件包、技能升级书、统御书残页、历练证明、资源包、以及钥匙等等比较稀有且便捷的物品。
但是商店里的物品是不刷新的，每天卖的都是一样的东西，而且玩家只能通过花费一定数量的钻石来进行购买所需要的物品。
当然玩家可以根据个人喜好来选择在黑市买还是商店中进行购买所需物品。